La laguna Miscanti está ubicada en el Altiplano y es uno de los 7 sectores de la reserva nacional Los Flamencos.
Está administrada, como su vecina Miñiques, por la Comunidad Atacameña de Socaire (queda a 28 km al sur de este pueblo) en asociatividad con la Corporación Nacional Forestal CONAF.
Se considera que fue precisamente a raÃz de una erupción de este volcán que se formaron las dos lagunas. Ambas se encuentran en el circuito de rutas turÃsticas de San Pedro de Atacama y generalmente son visitadas en una excursión especial o en otra más grande que incluye asimismo la laguna de Chaxa del salar de Atacama y los pueblos de Socaire y Toconao.